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Web请安装最新版版的busco, 在5.4.4 之前,针对于个别基因组会发生报错。 BUSCO依赖sepp,而sepp依赖依赖的python,与我的基础环境的python=3.9冲突,因此需要建立一个 … Web我们在安装 node-sass 的时候总是会因为各种原因不成功,今天我就一口气把这些可能导致失败的坑汇总一下,以免以后再被坑。. node-sass 安装过程分析. 首先了解一下 node-sass 安装的过程:. npm 拉下 node-sass包;. 根据node版本和node-sass版本拉取对应的binding.node编译器,原因是sass的编译语言比较特殊 ... td jakes psalms 91
记录安装 node-sass 失败原因及解决办法汇总 - 掘金
Webdiscord不让我进是吧,我给你旋转4分钟 在执行完毕之后,可以使用generate_plot.py画条形图,可以进行多个物种间同一个库结果的比较。 1. 首先把所有的经过BUSCO检测的物种结果short_summary.txt后缀文件放到一个文件夹(result)下; 2. 然后运行python busco/scripts/generate_plot.py –wd result; 3. generate_plot.py会在指定的目录下识 … See more busco --list-datasets#查看busco可用的数据库。 下载对应的busco数据库;目前有v1-v5版本,根据需要评估的物种,尽量选用最新版本的最多基因的数据库。 植物相关的数据库有: See more nohup busco -i genome.fa -c 10 -o busco -m geno -l busco_downloads/eudicots_odb10 --offline & 1. -i:指定需要分析的数据,组装的genome或者注释的 … See more 结果在short_summary.txt后缀文件中。 一个例子 结果的解释: 使用的eudicots_odb10真双子叶植物数据库中共有2326个BUSCO … See more nohup busco --config config.ini 通过conda安装的这config.ini配置文件在/path/to/miniconda3/envs/busco5/config/目录下;直接复制一份到工作目录,修改使用即可。 把config.ini的 … See more WebMar 29, 2024 · BUSCO目前已经更新到第4版,之前只用来评估基因组为目标,现在还能够预测基因和做系统基因组学分析。软件安装官方提供了docker,conda和GitLab这三种方法,这里我只介绍conda。conda create -n busco4 -c bioconda -c conda-forge busco=4.0.5conda activate busco4由于软件运行的时... eduka digitalni udzbenici